DTU Space DroneCenter danner og udvikler partnerskaber med såvel danske som udenlandske forskningsinstitutioner, myndigheder, organisationer og virksomheder.
Således er DTU Space DroneCenter medlem af den internationale interesseorganisation Association for Unmanned Vehicle Systems International (AUVSI) og den danske organisation UAS Denmark.
DTU Space DroneCenter samarbejder med flere danske virksomheder herunder Sky-Watch A/S, Litte Smart Things ApS, Integra A/S, Terma A/S og COWI A/S samt udenlandske virksomheder som Northrop Grumman Corporation, Boeing og Thales.
På forskningsfronten samarbejder DTU Space DroneCenter med bl.a. Geodatastyrelsen, Søfartsstyrelsen, Aarhus Universitet, NASA, NOAA (National Oceanic and Atmospheric Administration og det europæiske rumsamarbejde, ESA.